Struktur Organisasi SJI
DEWAN PEMBINA : Ahmad Asroni, M.Hum
DEWAN PENGAWAS : Erham Budi Wiranto, S.Th.I., M.A.
DEWAN PENGURUS
Ketua : Mukhlis Hidayat Rifai, S.Pd.I
Sekertaris : Ahmad Wahyu Sudrajad, M.Hum.
Bendahara : Fikry, S.Pd. M.Pd.
Bidang-bidang :
1. Bidang Program dan Pendanaan : Rachmanto, S.Fil., M.A.
2. Bidang Riset dan Publikasi Ilmiah : Siti fauziyah, S.Th.I., M.Ag
3. Bidang Pendidikan & Pelatihan : Ianatullah Ishomuddin, S.Fil, M.H.
4. Bidang Humas dan Media : Arif Sugeng Widodo, S.Fil., M.Phil.
5. Bidang Pelaksana Keuangan : Bela Mandasari, A.Md.Ak
Divisi SJI:
Divisi Riset & Inovasi
Divisi Community Service
Divisi Penerbitan (SJI Press, initiated/on going)
Divisi Jurnal Ilmiah (Interdisciplinary Journal of Social Issues and Policy [IJSIP], initiated/on going)